• アキハバラ博士(はかせ)は、みやぶられたことにかんしんして、サトシたちを研究所(けんきゅうしょ)のおくに、案内(あんない)する。サトシたちは暗(くら)いところで、きゅうにとじこめられる。そこはモンスターボールをおくるてんそうきのようなものだった。そこにアキハバラ博士(はかせ)の作(つく)ったCGポケモン・ポリゴンの初号機(しょごうき)がおくりこまれる。博士(はかせ)によると、へんな連中(れんちゅう)がポリゴンの0号機(ごうき)をうばい、このてんそうきを使(つか)いパソコンの世界(せかい)に入(はい)りこんだ。そしてやつらはそこで、てんそう中(ちゅう)のポケモンをぬすんでいるらしい。 
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